首先，小兒性結(jié)核性腦膜炎一般應(yīng)該與急性化膿性腦膜炎，病毒性腦膜炎，真菌性腦膜炎以及腦膜炎型腦囊蟲病相鑒別，腦脊液的不同改變以及病原學(xué)檢查是主要的鑒別診斷依據(jù)。
第一，化膿性腦膜炎，嬰幼兒結(jié)核性腦膜炎起病比較急的患者容易被誤診為化膿性腦膜炎，化膿性腦膜炎經(jīng)過不規(guī)則的抗生素治療腦脊液細(xì)胞數(shù)不是很高時，又容易誤診為結(jié)核性腦膜炎，在鑒別的時候除了有結(jié)核接觸史，結(jié)核菌素實驗以及肺部的x線檢查可以助診斷之外，重要的還是腦脊液的檢查，如果細(xì)胞數(shù)高于一千乘以十的六次方每升，并且分類以中性多形核粒細(xì)胞占多數(shù)時，應(yīng)該考慮化膿性腦膜炎，但更重要的是細(xì)菌性腦膜炎。
第二，病毒性中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染，主要有病毒性腦炎，病毒性腦膜腦炎以及病毒性脊髓炎，可能與結(jié)核性腦膜炎相混淆，各種病毒性腦膜炎的診斷要點：
1，有特定的流行季節(jié)。
2，有特殊的全身表現(xiàn)，比如腸道病毒可以伴有腹瀉，皮疹和心肌炎。
,3，腦脊液的改變除了細(xì)胞術(shù)語分類與結(jié)腦不同之外，他的生化改變也不相同，病毒性腦膜腦炎腦脊液的糖和氯化物是正常或者稍高，蛋白增高不明顯。
